油箱入水會導致油箱生銹、腐化、老化，燃油系統中如有水分含量會造成發動機功率下滑、耗油量增多、車輛抖動、冬季更難啟動等油箱入水會出現不易啟動、發動機回火、怠速過高或動力不足等現象。
燃油箱入水，問題小的是不易啟車，啟車后行駛加速沒力；嚴重的不著車，但沒有什么危險性安全事故出現。發動機曲軸箱入水，輕則異響潤滑，減少曲軸瓦、連桿瓦、凸輪軸瓦，及配氣機構的氣門導管等的使用期限。嚴重的，曲軸抱死，或連桿斷，缸體破裂。
油箱吸到一點點水也能造成的問題不嚴重，因為有柴油濾清器和油水分離器能夠過濾，或許過多的話也不可以。會造成發動機損壞。如果水大量的話，會立即損壞，有可能會熄火拉缸。
如果油箱是少量入水發動機能夠正常情況下啟車運行，能夠 添加一些燃油添加劑如油箱除水劑，燃油寶等以幫助發動機更好的燃燒。
如果油箱或油道進入了很多的水，現已干擾到發動機的正常情況下啟車，把油全部抽出來清洗油箱，清洗油泵總成，換上新的油。
合格的燃油出廠時并不會帶有雜物和水分的，但在運輸和儲存過程中可能會混入塵埃、污物及水分含量；當油箱沒有裝滿柴油時，箱內空氣中水分含量易形成冷凝水滴混入柴油中。柴油發電機組采用不純的柴油易于出問題。燃油的采用和儲存上應注意下面幾點：
燃油先要在油箱內存放24小時以上，使水和雜物沉淀后采用；
每回工作完畢后將日用油箱裝滿，這種能夠避免油箱空氣中的水分含量混入燃油內；
加油時先要將漏斗、油箱端蓋擦干凈，采用手搖泵時，注意不要將低部沉積物一起抽出；
定期打開油箱排積水、沉淀。
為濾除燃油中的有害雜質和水分，保護發動機的正常工作，避免堵塞，減少磨損，提高發動機壽命，所以發電機組柴油濾清器和油水分離器。油水分離器裝在油箱附近，用來把柴油里的水分分離出來。柴油從油箱出來經過油水分離器后再到柴油慮清器，才進入柴油泵、高壓油泵。


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